El Patronato de la Fundación Ilundáin Haritz-Berri es el encargado de velar por el cumplimiento de los fines fundacionales y la administración de los bienes y derechos que integran el patrimonio de la Fundación. Se trata de un órgano de gobierno que, entre otras competencias, se encarga de confeccionar y aprobar los presupuestos de la Fundación.