El Departamento de investigación, desarrollo e innovación tiene dos vertientes en su actuación:
Prestar un Servicio Interno al resto de departamentos, programas y equipo directivo a través de un asesoramiento técnico y propuestas de innovación y desarrollo.
Promoción de la imagen corporativa, dando a conocer a la sociedad la misión y objetivos de la Fundación, los servicios que está prestando, y haciendo participe a la Fundación en organizaciones y redes solidarias.
Englobados dentro de este departamento se encuentran insertos dentro del proceso de mejora continua están el responsable de calidad y el responsable de riesgos laborales. Su sede se encuentra en la calle Monasterio de Iranzu 8, en el barrio de San Juan de Pamplona.